前排正中就坐的上将是张震副主席，前排右起第二位鞠躬院士
为了遵照父亲的“医学救国论”，鞠躬院士于1947年考上长沙的湘雅医学院。抗战期间日军占领长沙前，湘雅医学院院长带领全校师生向西南迁移。抗战胜利后日本兵把湘雅医学院烧得一干二尽，只剩下湘雅医院坍塌的骨架及一座小屋。湘雅医学院回到长沙后，首先重建高质量的医院和图书馆，其他只能一律从简。师生的生活及教学条件极差，但老师仍然认真教，学生努力学，保证了教学质量。鞠躬的学习成绩名列前茅。本应是1953年毕业的鞠躬和同学们，为了尽快服务于国家和社会要求取消五年的见习，同时放弃暑假，以补剩下的统计学和放射学课。经校方同意后，他们就在第五年直接执行住院医生职务，1952年就提前毕业了。毕业时每人可选择三个志愿。因为喜欢做研究工作，所以鞠躬院士的第一志愿选择了生理学，是因为生理学要做实验及推理，而且他父亲从小就培养他动手能力，生理实验上做得非常好，因此受到了教授的肯定；第二个志愿选择了细菌学；第三个志愿选择了病理学。之所以选择病理学，一方面是因为它在医学上的重要性，另一方面是因为日本人放火把所有仪器设备都烧毁了，但只要有一台普通显微镜和病理标本鞠躬院士就可以做研究工作。
毕业时学生和校领导的合影
前排正中着浅色服装的政委的左手侧是凌敏猷校长，鞠躬站在他后面 解放前，中国的医学院少，而且良莠不齐，因此需要新建许多医学院以满足新中国发展的需求。但那时缺少好师资，所以在各名校如协和医学院、北京大学医学院、湘雅医学院、上海医学院等成立了高级师资训练班,全国医学院应届毕业生（除北京协和医学院的毕业生外）均被分派到各高级师资训练班。鞠躬院士正好被指定到了北京协和医学院解剖学系高级师资训练班。一年后结业，解剖学系主任问鞠躬是否愿意留下来，送他去苏联留学。鞠躬喜出望外。第二天主任告诉他，学校只容解剖学系留一个学生，并指定了另一个学生。他也很优秀，而且是解放前的地下党员。鞠躬觉得很合理。随即总后勤卫生部把鞠躬院士分配到大西北的西安第四军医大学解剖学教研室。
艰苦岁月中受磨炼，专注科研硕果累累
建国初期的西安非常落后，老百姓的描述是“马路不平，电灯不明，电话不灵”。这对于出生和长大在上海的鞠躬院士来说是难以想象的。他回忆：“那时候，西安如逢下雨天进城，一脚踩下去泥浆灌满鞋。第四军医大学在西安东郊占一大片地，以前是乱坟地，往往有人洗衣服后把一盆脏水一泼，地面塌陷了，洗衣盆掉进了浅坟坑，与尸骨为伍！我住的宿舍是砖砌的墙和地，竹编的天花板”。这样的艰苦的环境之下根本谈不上科学研究。1954年总后勤卫生部令南京的第五军医大学（原中央大学医学院）整体迁来西安和第四军医大学合并。为迎接合并，学校为行政机关及教研室盖了一栋五层大楼，就这样鞠躬院士也有了一些研究设备和属于自己的办公室，虽然只是一个4平方米的小空间，但这并没有阻挡他的科研热情。在缺乏一些小设备的情况下，他提出了“‘没有枪，没有炮’我自己造”的口号。“我自己设计的土仪器不下十余种。我所设计出来的个别土设备甚至比洋设备还好用。办法总归有的，只不过是好一点或差一点而已”鞠躬院士说道。
